Si queremos limitar el tamaño de subida de un fichero en Apache, deberemos utilizar la directiva LimitRequestBody. Para ello deberás acceder al archivo de configuración httpd.conf e indicar lo siguiente:
<Directory "/usr/local/apache2/uploads"> LimitRequestBody 20000 </Directory>
Donde en Directory indicaremos la ruta del directorio que queremos limitar y en LimitRequestBody indicaremos el tamaño máximo en bytes. En el caso de querer un valor ilimitado deberemos escribir 0.